Q.都道府県をまたいで医療法人の分院を開設したいのですが、定款変更認可申請を提出するのはどこの都道府県でしょうか?

主たる事務所の所在地の都道府県です。

具体的には、医療法人の本店が所在する都道府県の医療福祉局に、医療法人の分院開設の届出とともに、定款変更認可申請を提出することになります。